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除了新冠核酸檢測(cè),PCR實(shí)驗(yàn)室還能做些什么呢?
2023-05-31

PCR實(shí)驗(yàn)室又叫基因擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)室,實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)是DNA定量技術(shù)的一次飛躍,是用于放大特定的DNA片段,可看作生物體外的特殊DNA復(fù)制。

通過(guò)DNA基因追蹤系統(tǒng),能迅速掌握患者體內(nèi)的病毒含量,其精確度高達(dá)納米級(jí)別。而實(shí)時(shí)熒光定量PCR則是實(shí)現(xiàn)該項(xiàng)技術(shù)的載體。PCR實(shí)驗(yàn)常用來(lái)檢驗(yàn)艾滋病、乙型肝炎、禽疫病等病毒感染性疾病,通過(guò)將病毒體內(nèi)所含的基因進(jìn)行擴(kuò)增的方法,測(cè)出一些病毒含量不高的感染者體內(nèi)是否含有特定的病毒。PCR檢測(cè)方法具有靈敏度高、特異性高、快捷、對(duì)樣品要求低等優(yōu)點(diǎn),因此被臨床醫(yī)生廣為認(rèn)可,已廣泛應(yīng)用于醫(yī)院的臨床診斷和各防疫檢測(cè)部門的禽疫病診斷。

在國(guó)家政策和疫情發(fā)展的推動(dòng)下,各地區(qū)各級(jí)醫(yī)院都開(kāi)始或者準(zhǔn)備建立獨(dú)立合規(guī)的PCR實(shí)驗(yàn)室,都已具備核酸檢測(cè)能力已經(jīng)成為各醫(yī)療機(jī)構(gòu)。但由于各地區(qū)疫情的差異化使得長(zhǎng)期低風(fēng)險(xiǎn)地區(qū)的一些核酸實(shí)驗(yàn)室除了具備應(yīng)急功能之外幾乎處于停滯狀態(tài)。此類情況也是各級(jí)醫(yī)院領(lǐng)導(dǎo)在建立實(shí)驗(yàn)室最擔(dān)心的問(wèn)題,投入了資金和精力但又不能給醫(yī)院帶來(lái)創(chuàng)收。


PCR實(shí)驗(yàn)室其實(shí)功能極其強(qiáng)大,定性分析和定量檢測(cè)是它最大的兩個(gè)應(yīng)用方向,那除了新冠核酸檢測(cè),我們“萬(wàn)能”的PCR實(shí)驗(yàn)室還能做些什么呢?接下來(lái)就給大家展示幾個(gè)具體應(yīng)用方向的項(xiàng)目示例,也希望通過(guò)這些示例可以給各級(jí)醫(yī)療系統(tǒng)提供一些項(xiàng)目開(kāi)展的思路和方向。


(一)病原體測(cè)定

PCR技術(shù)的問(wèn)世使病原體檢測(cè)能夠快速、方便地進(jìn)行。由于PCR技術(shù)假陽(yáng)性率太高,只要有微量病原體存在就可得到陽(yáng)性結(jié)果,這并不能作為診斷依據(jù),只有當(dāng)一定數(shù)量的病原體存在時(shí)才有臨床意義。因此,對(duì)模板準(zhǔn)確定量顯得特別重要,應(yīng)用熒光技術(shù)PCR就能夠快速、準(zhǔn)確地得到結(jié)果。對(duì)于解決免疫學(xué)檢測(cè)的“窗口期”問(wèn)題,判斷疾病是否處于隱性或亞臨床狀態(tài),以及抗體檢測(cè)不能判定是現(xiàn)癥感染還是既往感染時(shí),均可利用PCR進(jìn)行確定。

示例:新型冠狀病毒核酸檢測(cè)。

方法學(xué):熒光PCR法。

用途:用于體外定性檢測(cè)新型冠狀病毒感染的肺炎疑似病例、疑似聚集性病例患者、其他需要進(jìn)行新型冠狀病毒感染診斷或鑒別。

檢測(cè)基因:新型冠狀病毒(2019-nCoV)ORFlab和N基因、E基因。

標(biāo)本類型:上呼吸道標(biāo)本:咽拭子、鼻拭子;下呼吸道標(biāo)本:呼吸道抽取物、肺泡灌洗液樣本、肺組織活檢標(biāo)本。

檢測(cè)流程:

(1)核酸檢測(cè)前的生物安全防護(hù)(工作人員個(gè)人三級(jí)防護(hù)的穿戴)→(2)樣本的滅活(56℃滅活30分鐘)→(3)樣本的核酸提取(手工、核酸提取儀)→(4)PCR體系的配制和模板加樣→(5)上機(jī)檢測(cè)及結(jié)果分析→(6)檢測(cè)后的消毒。

其他病原體檢測(cè):HIV、甲乙丙肝、HPV、肺支、肺衣、EB病毒、腺病毒、胞病毒、甲乙流、埃博拉病毒、B族鏈球菌。

適合開(kāi)展的醫(yī)院和科室:兒童醫(yī)院、婦幼、兒檢所、第三方、各種級(jí)別的有需求的醫(yī)院。


(二)遺傳病檢測(cè)

基因突變和拷貝數(shù)變異是遺傳病發(fā)生的主要遺傳學(xué)基礎(chǔ),也是遺傳病檢測(cè)的主要靶標(biāo)。遺傳病的復(fù)雜性伴隨著基因突變數(shù)目多、類型廣;基因拷貝數(shù)變異不僅表現(xiàn)為缺失和復(fù)制,而且缺失位置、大小以及復(fù)制倍數(shù)都呈現(xiàn)多樣性。遺傳變異的復(fù)雜性為遺傳病的臨床檢測(cè)提出了技術(shù)挑戰(zhàn)。實(shí)時(shí)PCR技術(shù)是我們最近發(fā)展起來(lái)新一代實(shí)時(shí)PCR技術(shù),利用熒光標(biāo)記或熔點(diǎn)分析,可以在單個(gè)反應(yīng)管內(nèi)檢測(cè)多個(gè)靶標(biāo)。

示例:人Y染色體AZF區(qū)微缺失檢測(cè)。

方法學(xué):熒光PCR法。

用途:本產(chǎn)品用于定性檢測(cè)男性全血樣本中 Y 染色體無(wú)精子癥因子。(azoospermia factor,AZF)區(qū)域是否存在缺失,具體檢測(cè)缺失位點(diǎn)為:AZFa:sY84、sY86;AZFb:sY127、sY134;AZFc:sY254、sY255;AZFd:sY145、sY152。

臨床研究表明,Y 染色體 AZF 區(qū)(AZFa, AZFb, AZFc, AZFd)不同程度的缺失可導(dǎo)致男性的少精癥、無(wú)精癥或精子畸形等癥狀,從而導(dǎo)致男性不育。本試劑盒可輔助診斷確診不孕不育患者的病因分析,檢測(cè)結(jié)果僅供臨床參考,不能單獨(dú)用做確診或排除病例等臨床診斷的依據(jù)。

標(biāo)本類型:全血。

檢測(cè)流程:

(1)樣本處理及 DNA 提取(在標(biāo)本制備區(qū)完成)→(2)樣本處理及 DNA 提?。ㄔ跇?biāo)本制備區(qū)完成)→(3)加樣(在標(biāo)本制備區(qū)完成)→(4)PCR 擴(kuò)增(在擴(kuò)增區(qū)完成)→(5)結(jié)果分析與判定。

其他同類項(xiàng)目:地貧、耳聾、苯丙酮尿癥(PKU)、蠶豆?。℅6PD)、脊髓型肌萎縮(SMA)、進(jìn)行性肌營(yíng)養(yǎng)不良(DMD)、強(qiáng)直性脊柱炎(HLA)、血友病。

適合開(kāi)展的醫(yī)院和科室:婦幼、第三方、各種級(jí)別的有需求的醫(yī)院。


(三)個(gè)性化用藥

藥理學(xué)和藥物基因組學(xué)的發(fā)展,闡明了藥物代謝和效應(yīng)個(gè)體差異的遺傳本質(zhì),藥物異常反應(yīng)主要是因?yàn)樗幬锎x酶基因變異而導(dǎo)致酶活性異常,進(jìn)而導(dǎo)致服藥后體內(nèi)藥物未能被正常代謝、消除而排出體外,使得體內(nèi)藥物濃度過(guò)高或過(guò)低,達(dá)不到理想的治療效果。這種異常藥物反應(yīng),可通過(guò)檢測(cè)與患者所服用藥物相關(guān)的遺傳基因,調(diào)整藥物劑量或?qū)ふ姨娲幬铮畲蟪潭鹊刂贫ǔ龈侠?、有效、?jīng)濟(jì)的藥物治療方案。

示例:心血管個(gè)體化用藥指導(dǎo)檢測(cè):CYP2C19基因突變檢測(cè)試劑盒、CYP2C9基因突變檢測(cè)試劑盒、ALDH2基因突變檢測(cè)試劑盒、MTHFR基因突變檢測(cè)試劑盒。

方法學(xué):熒光PCR法。

用途:氯吡格雷、華法林、硝酸甘油及葉酸均為心血管臨床上常見(jiàn)的藥物,心血管用藥指導(dǎo)分子生物學(xué)檢測(cè),明確基因分型,藥學(xué)部臨床藥師根據(jù)檢測(cè)結(jié)果,并綜合考慮患者自身因素、臨床診斷以及聯(lián)合用藥等相關(guān)信息,為臨床出具個(gè)體化用藥建議。

標(biāo)本類型:全血(本試劑盒無(wú)需提取DNA,加樣直接PCR)。

檢測(cè)流程:

(1)配制反應(yīng)體系(在樣本準(zhǔn)備區(qū)完成)→(2)直接加入全血(在標(biāo)本制備區(qū)完成)→(3)PCR 擴(kuò)增(在擴(kuò)增區(qū)完成)→(4)結(jié)果分析與判定。

其他同類項(xiàng)目:他汀類用藥(ApoE)、β受體阻滯劑(ADRB1)、兒童安全用藥、腫瘤靶向化療個(gè)性化用藥(EGFR、kRAS)類。

適合開(kāi)展的醫(yī)院和科室:心血管醫(yī)院、腫瘤醫(yī)院、第三方、各種級(jí)別的有需求的醫(yī)院。


(四)腫瘤研究

腫瘤是危害人類健康的一種疾病,它的惡性程度與預(yù)后判斷主要依靠是否有轉(zhuǎn)移和病理切片分期。隨著分子生物學(xué)的迅猛發(fā)展,腫瘤研究領(lǐng)域的大量研究成果顯示,腫瘤的發(fā)生、發(fā)展、治療和預(yù)后與腫瘤細(xì)胞內(nèi)部基因和腫瘤相關(guān)病毒有關(guān)。很多原癌基因和抑癌基因的表達(dá)情況的檢測(cè)都可揭示了癌變的可能性,而PCR方法學(xué)可以解決此類問(wèn)題,此外,PCR方法用于體外定性檢測(cè)人外周血血漿中septin9基因甲基化,用于各種腫瘤的臨床輔助診斷。

標(biāo)本類型:全血/組織。

檢測(cè)流程:

(1)PCR反應(yīng)體系構(gòu)建(在試劑準(zhǔn)備區(qū)完成)(2)樣本處理及 DNA 提取(在標(biāo)本制備區(qū)完成)→(3)亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化(在標(biāo)本制備區(qū)完成)→(4)PCR 擴(kuò)增(在擴(kuò)增區(qū)完成)→(5)結(jié)果分析與判定。

其他同類項(xiàng)目:SHOX2基因、RASSF1A基因、SDC2基因甲基化、MGMT基因甲基化、RNF180、her2。

適合開(kāi)展的醫(yī)院和科室:腫瘤醫(yī)院、第三方、各種級(jí)別的有需求的醫(yī)院。


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